Nelle missioni tattiche di Marvel's Midnight Suns, collaborerai con un massimo di altri due eroi al fine di completare determinati obiettivi, come eliminare una serie di nemici, impedire la fuga di un bersaglio, proteggere un dispositivo e molto altro ancora. Per completare le missioni è necessario disporre di un approccio strategico. Non importa come o quali amicizie scegli di coltivare con i vari membri del team: una volta iniziata la missione, la cosa più importante è essere pronti ad adattarsi a un campo di battaglia in continua evoluzione.
All'inizio del combattimento, tutte le Abilità Eroe che hai scelto vengono rimescolate in modo casuale. Ad ogni turno prenderai automaticamente le Abilità Eroe in modo casuale, determinando a quale di esse hai inizialmente accesso in quel turno. Il tuo turno finisce quando hai esaurito tutte le azioni che puoi (o vuoi) fare, che non includono solo l'uso delle Abilità.
Gli eroi potranno sfruttare la loro forza e il loro ingegno per trasformare gli Oggetti ambientali in potenti armi. Potrai raccogliere e lanciare una cassa, lanciarti da una roccia per colpire un nemico sottostante con un attacco caricato, scagliare un lampione addosso a un gruppo di nemici e molto altro ancora. Sta a te scegliere la strategia più efficace. Per eseguire questo tipo di attacchi, gli eroi dovranno trovarsi in prossimità di Oggetti ambientali. Inoltre, dovranno essere posizionati in un'area in cui possono colpire i nemici e avere la giusta quantità di Eroismo richiesta per l'attivazione dell'attacco.
Una volta per turno, potrai riposizionare uno dei tuoi eroi utilizzando un'azione Movimento. Con questa azione, potrai posizionare un eroe in modo da permettergli di utilizzare un'abilità in grado di colpire più nemici in un colpo solo. In caso il tuo turno stia per finire, invece, potrai utilizzarla per allontanarlo dai nemici e metterlo al sicuro da eventuali attacchi. Se presti attenzione al posizionamento dei tuoi eroi e sfrutti le loro abilità al meglio, riuscirai a portare a termine ogni singola missione.
