在《漫威午夜之子》裡,玩家的每一天都會從莊園展開。莊園這個遷移過的特蘭西亞堡壘,數百年來一直安全地藏在麻州塞勒姆山崖邊的次元空間中。莊園也是午夜之子的總部與行動基地,負責所有戰鬥以外的策略決策。
莊園裡的不同房間讓玩家能夠運用從先前戰術任務中獲得的各種獎勵,例如研究文物容器、分析伽瑪線圈,以及解密情報包等等。這些獎勵能幫助玩家製造新物品以及升級能力,讓午夜之子為接下來的戰術任務做好準備。玩家也能在莊園和遊戲裡的角色扮演機制互動,並與其他英雄建立友誼。