Com o aumento do perigo de Lilith e da Hidra no mundo todo, a Sala de Guerra permite que os Midnight Suns monitorem e reajam às ameaças que surgem. Suas principais estações são a mística Mesa Espelhada e a estação de trabalho C.E.N.T.R.A.L.

Todas as missões atualmente disponíveis são exibidas no mapa de batalha estratégico da Mesa Espelhada, permitindo que você escolha e ative a missão em que quer embarcar com os Midnight Suns. A Mesa Espelhada também detalha os requisitos, recompensas e a dificuldade de cada missão.

Criada com tecnologia patenteada Stark, a estação de trabalho C.E.N.T.R.A.L. permite que a Capitã Marvel decodifique Unidades de Dados obtidas nas missões. Os Dados que ela obtém são um recurso que você pode gastar para mandar heróis em Operações Heróicas especiais, que concedem novas habilidades de herói e outras recompensas quando são concluídas com sucesso.

Várias melhorias podem ser adquiridas e instaladas nos sistemas da sua Sala de Guerra, cada uma desbloqueando novos projetos ou oferecendo outros benefícios únicos. Por exemplo, a Transferência da S.H.I.E.L.D. permite que os Midnight Suns obtenham recursos da S.H.I.E.L.D., e o terminal S.T.R.I.K.E. desbloqueia a possibilidade de os heróis interrogarem inimigos em missões táticas.