마블미드나잇선즈의전투임무에서는미니언, 엘리트, 보스로구성된적과조우하게됩니다. 미니언들은숫자가많을때특히위협적이지만, 펀치부터환경오브젝트에의한공격까지다양한유형의피해를받으면곧바로쓰러집니다. 이와다르게엘리트적은체력바를갖고있으며, 여러번의공격으로쓰러뜨려야합니다. 보스는게임에서가장강력한적입니다. 이들은큰피해를줄뿐만아니라특별한능력을보유하고있기때문에아무리미드나잇선즈의히어로들이라도손쉽게쓰러뜨릴수없습니다.
미니언과엘리트들은다음턴에어떤히어로를공격할것인지나타내는히어로아이콘이머리위에표시됩니다. 이를활용하면표적의우선순위를정하거나어떤팀원을회복할것인지등정보에근거한결정을내릴수있습니다. 단, 보스는공격계획을별도로드러내지않기때문에, 예측을통한대응방안을마련하기가더욱어렵습니다.
대부분의임무에서적들은자신의턴이종료될때주기적으로증원군을부릅니다. 새로운적군의웨이브는미니언과엘리트로구성되어있으며, 점점늘어나는적의숫자를무시했다간, 순식간에플레이어의분대를압도할수있습니다. 단, 증원군은부가목표를완료할경우저지할수도있지만, 어떤임무에서는끝날때까지새로운적이계속해서등장하기도합니다. 그래도여러분이손수선별한히어로들로이루어진팀이라면문제없을겁니다.