Dans Marvel's Midnight Suns, chaque ennemi que vous affrontez lors des missions de combat peut être un sbire, un expert ou un boss. Les sbires représentent une véritable menace, notamment en grand nombre, mais seront éliminés au moindre dégât subi, qu'ils soient simplement frappés ou projetés à travers le champ de bataille. Les experts possèdent une barre de vie et devront être attaqués à de multiples reprises pour être vaincus. Les boss, quant à eux, seront les adversaires les plus puissants que vous rencontrerez. En plus de disposer d'une barre de vie plus conséquente, ils infligent d'importants dégâts et peuvent faire appel à des capacités spéciales. Les vaincre représente un défi de taille, même pour les membres des Midnight Suns.

Des icônes de héros apparaîtront au-dessus des sbires et des experts, en fonction du héros qu'ils prévoient d'attaquer lors de leur prochain tour. N'hésitez pas à vous servir de cette information afin d'affiner votre stratégie. Vous pourrez, entre autres, choisir vers quel ennemi diriger vos attaques ou quel allié soigner en priorité. Les boss, quant à eux, ne dévoileront pas leur intention. Vous ne pourrez donc pas prédire aussi facilement leurs actions et planifier avec certitude votre contre-attaque.

Dans la plupart des missions, vos ennemis appelleront régulièrement des unités de renfort à la fin de leur tour. Ces vagues d'ennemis supplémentaires seront constituées de sbires et d'experts, et leur nombre pourrait bien finir par vous submerger si vous ne réussissez pas à les contenir. Les renforts pourront parfois être neutralisés si vous parvenez à réaliser un objectif secondaire. Dans d'autres circonstances, de nouveaux ennemis continueront d'apparaître jusqu'à ce que l'objectif de votre mission soit atteint. Cela étant dit, il en faut plus pour impressionner une équipe de super-héros triés sur le volet, pas vrai ?