大聖院の庭園にあるポータルからアクセスできるT.H.R.E.A.T. ルームを強化すると、訓練ミッションをカスタマイズできるようになります。常に1人のヒーローで3ターンにわたってソウルレスの敵と戦う代わりに、最大3人までのヒーローを選択して、これまでに遭遇したことのあるヒドラ、ソウルレス、ヴァンパイア、リリンの敵とランダムに戦うことが可能です。さらに遭遇する敵の難易度を設定する、新たなオプションも追加される予定です。より強い敵からはさらにXPを獲得できます。

強化 T.H.R.E.A.T. ルームをアップグレードすると、訓練ミッションをカスタマイズするオプションをさらにアンロックできます。カスタマイズでは、戦う敵を4種類から選ぶ、遭遇したことのあるフォールンまたはヴィランを追加する、ミッションの3段階の難易度設定から選択するなどが可能です。通常のT.H.R.E.A.T. ルームと同様に、ヒーローは1日1回訪問でき、最高レベルのチームメイトと同じレベルに達するまで経験値を稼ぐことができます。

「鮮血の嵐」DLCにより、この大聖院のアップグレードを行うことができ、さらにストームがミッドナイト・サンズに加わります。このDLCは、個別購入が可能なほか、『マーベルミッドナイト・サンズ』シーズンパスに含まれます（プレイするには『マーベルミッドナイト・サンズ』ゲーム本編が必要です）。ストームのコンテンツは、ゲームプレイによりアンロックされます。